FITMASTER - программа просмотра, анализа и аппроксимации электрофизиологических данных
Увеличить | С помощью программы FITMASTER можно выполнить анализ и аппроксимацию электрофизиологических данных, полученных в патч-кламп экспериментах. |
FITMASTER выполняет анализ и аппроксимацию электрофизиологических данных. Анализ может проводиться над кривыми (Sweeps/Traces) или сериями (Series). Кроме стандартных функций приближения, таких как многочлены, экспоненты, кривые Гаусса и Больцмана и пр. (применяемых для трассировки токов с целой клетки по формальным уравнениям Ходжкина-Хаксли) имеется также анализ вольт-амперных кривых.
Возможности анализа данных в реальном времени, имеющиеся в программе PATCHMASTER, включены также в FITMASTER. В принципе, FITMASTER дает возможность более специфического анализа данных с построением дерева анализа. Идеология работы FITMASTER напрямую связана с древовидной структурой данных, генерируемой PATCHMASTER вплоть до уровня серий данных. Следовательно, FITMASTER имеет эквивалентные иерархические уровни анализа, группированные по кривым или по сериям. Самый низкий уровень анализа – это анализ отдельной кривой (Trace) одной записи. Диалог TraceFit позволяет выбрать конкретный Trace и вид производимого над ним анализа. Данные, организованные в серии могут быть переданы в окно анализа SeriesFit. В отличие от PULSEFIT, FITMASTER позволяет объединять данные на уровне серий при помощи концепции нового волнового буфера. Несколько результатов обработки TraceFit могут быть скомпилированы в волновой буфер и нарисованы при помощи графических инструментов в окне SeriesFit.
На уровне TraceFit программа FITMASTER вводит новое понятие функций циклического анализа (Cyclic Analysis). Это дает возможность автоматически проводить несколько видов анализа над одним элементом Trace.
Имеются функции экспорта результатов в программу IGOR и в виде текстовых ASCII файлов.
- Структурированный анализ
- Объединение результатов нескольких экспериментов
- Анализ периодических данных (train-type data)
- Буфер обмена
- Работа с отдельными элементами записей (Traces)
- Расчет соотношений тока/напряжения
- Более богатый набор функций анализа, по сравнению с PULSEFIT
- Экспорт результатов в IGOR и в виде текстовых ASCII файлов